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科研服务

菌种鉴定需提取基因组DNA,利用PCR扩增特定rDNA片段,在GeneBank上进行序列比对,一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种菌。箭速基因拥有微生物菌种分类鉴定的分子生物学实验室,配有PCR仪、高速冷冻离心机、电泳仪、HPLC、凝胶成像系统、紫外控温分析系统等先进仪器设备,采用序列分析法,方便、快捷地完成各种细菌的分子生物学鉴定帮助您获得真实、可信的结果。


样本类型

1.样品形式要求:带有单一菌种的单菌落培养平板或斜面(比例占试管1/2以上,但不要超过3/4)、无明显降解的基因组DNA(浓度不低于10 ng/μl,总体积至少大于20μl)。

2.对于细胞壁较厚的革兰氏阳性细菌,常规方法难以破坏细胞壁,建议您提供基因组DNA(用乙醇沉淀法去除PCR抑制物)。

3.厌氧菌、放线菌等特别菌株请在服务开展前与技术支持进行沟通。

4.为保证实验顺利进行,建议样本低温运输。


一、细菌菌种鉴定

细菌的rRNA有5S、16S和23S三种。其中16S rRNA分子量约1500bp,所代表的细菌信息量适中,适合进行分类研究。


服务内容

1、细菌16S rDNA部分序列解析

扩增细菌16S rRNA的全长序列,只使用Seq forward进行一个测序反应(有效序列500~600 bp),即可得到含有部分种属特异性的16S信息,是一种较为经济便捷的鉴定方法。

2、细菌16S rDNA全序列解析

扩增细菌16S rRNA的全长序列,长度约1400 bp~1500 bp,进行三个测序反应,测得全长序列,即较为全面的种属特异性信息。


价格及周期

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交付内容

1、PDF版实验报告

2、测序彩色波形图

3、序列碱基图

4、NCBI比对结果


二、真菌26S rDNA D1/D2区序列解析

真菌基因组中编码核糖体RNA的基因有四种:26S rDNA、5S rDNA、18S rDNA和5.8S rDNA.真菌大亚基上的26S rDNA 可分为D1、D2…D12等多个区域,其中D1/D2区域序列长度适中,适合于真菌鉴定。


服务内容

1、真菌26S rDNA D1/D2区序列解析。

扩增真菌26S rDNA D1/D2区片段,长度约500~600 bp,只需进行一个测序反应,即可得到26S rDNA D1/D2区序列信息。该方法特别适合酵母菌的鉴定。

2、真菌ITS全列序列解析。 

PCR扩增真菌ITS区片段,长度约300~1,000 bp,依据PCR扩增片段的长度,进行一个至两个测序反应,即可得到ITS区全序列信息。对于一些真菌,26S rDNA D1/D2区或ITS区结构复杂,进行一个方向的测序可能不能得到全序列,这时需同时进行反方向的序列测定。


价格及周期

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交付内容:

1、PDF版实验报告

2、测序彩色波形图

3、序列碱基图

4、NCBI比对结果


订购流程

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